MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789

Total Repeats: 132798

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018508	CCA	2	6	8	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018508	CCG	2	6	23	28	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018508	GCC	2	6	37	42	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018508	CCG	2	6	53	58	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018508	CCA	2	6	83	88	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018508	GCC	2	6	97	102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018508	TAT	3	9	159	167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018508	GCA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018508	A	7	7	268	274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018508	AG	3	6	280	285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018508	TCC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018508	A	8	8	394	401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018508	TA	4	8	403	410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018508	GGT	2	6	417	422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018508	TAG	2	6	467	472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018508	AGTGGC	2	12	506	517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018508	TA	3	6	538	543	50 %	50 %	0 %	0 %	434373508
18	NC_018508	TA	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	434373508
19	NC_018508	A	8	8	678	685	100 %	0 %	0 %	0 %	434373508
20	NC_018508	AATG	2	8	687	694	50 %	25 %	25 %	0 %	434373508
21	NC_018508	CAC	2	6	723	728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434373508
22	NC_018508	TTG	2	6	734	739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434373508
23	NC_018508	TAA	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434373508
24	NC_018508	TAT	2	6	801	806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373508
25	NC_018508	ATG	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373508
26	NC_018508	AATGG	2	10	881	890	40 %	20 %	40 %	0 %	434373508
27	NC_018508	AG	3	6	898	903	50 %	0 %	50 %	0 %	434373508
28	NC_018508	TAT	2	6	915	920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373508
29	NC_018508	CATT	2	8	982	989	25 %	50 %	0 %	25 %	434373508
30	NC_018508	AGT	2	6	1155	1160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373508
31	NC_018508	TCT	2	6	1166	1171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373508
32	NC_018508	ATT	3	9	1228	1236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373508
33	NC_018508	GGA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434373508
34	NC_018508	AAG	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373508
35	NC_018508	AGA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373508
36	NC_018508	TAA	2	6	1320	1325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434373508
37	NC_018508	CTT	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373508
38	NC_018508	CAT	3	9	1393	1401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434373508
39	NC_018508	AAAT	2	8	1402	1409	75 %	25 %	0 %	0 %	434373508
40	NC_018508	AAT	2	6	1461	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018508	AGA	2	6	1480	1485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018508	TAT	2	6	1541	1546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373509
43	NC_018508	ATT	2	6	1658	1663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373509
44	NC_018508	TGT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434373509
45	NC_018508	T	6	6	1721	1726	0 %	100 %	0 %	0 %	434373509
46	NC_018508	GTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373509
47	NC_018508	ATTC	2	8	1782	1789	25 %	50 %	0 %	25 %	434373509
48	NC_018508	TGA	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373509
49	NC_018508	TCG	2	6	1910	1915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434373509
50	NC_018508	GAT	2	6	1928	1933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373509
51	NC_018508	AT	3	6	1943	1948	50 %	50 %	0 %	0 %	434373509
52	NC_018508	GAA	2	6	1974	1979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373509
53	NC_018508	CA	3	6	2087	2092	50 %	0 %	0 %	50 %	434373509
54	NC_018508	AATAA	2	10	2128	2137	80 %	20 %	0 %	0 %	434373509
55	NC_018508	GAG	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018508	A	6	6	2174	2179	100 %	0 %	0 %	0 %	434373510
57	NC_018508	CGATTT	2	12	2272	2283	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434373510
58	NC_018508	TAG	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373510
59	NC_018508	TCT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373510
60	NC_018508	ATA	2	6	2349	2354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434373510
61	NC_018508	ATG	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373510
62	NC_018508	CGTA	2	8	2545	2552	25 %	25 %	25 %	25 %	434373510
63	NC_018508	GAA	2	6	2561	2566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373510
64	NC_018508	AATT	2	8	2577	2584	50 %	50 %	0 %	0 %	434373510
65	NC_018508	GTA	3	9	2624	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373510
66	NC_018508	TAA	2	6	2713	2718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434373510
67	NC_018508	ATTTA	2	10	2744	2753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018508	TA	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018508	ATGT	2	8	2770	2777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018508	AT	3	6	2788	2793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018508	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373511
72	NC_018508	TCT	2	6	3010	3015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373511
73	NC_018508	ATA	2	6	3016	3021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434373511
74	NC_018508	TACA	2	8	3049	3056	50 %	25 %	0 %	25 %	434373511
75	NC_018508	AGGTGA	3	18	3071	3088	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434373511
76	NC_018508	TTG	2	6	3100	3105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434373511
77	NC_018508	AAAG	2	8	3113	3120	75 %	0 %	25 %	0 %	434373511
78	NC_018508	CAG	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434373511
79	NC_018508	ATG	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373511
80	NC_018508	GAA	2	6	3240	3245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373511
81	NC_018508	TTC	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373511
82	NC_018508	CAG	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434373511
83	NC_018508	GGT	2	6	3360	3365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434373511
84	NC_018508	T	7	7	3427	3433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018508	TTG	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434373512
86	NC_018508	GAA	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373512
87	NC_018508	A	6	6	3666	3671	100 %	0 %	0 %	0 %	434373512
88	NC_018508	ATT	2	6	3674	3679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373512
89	NC_018508	ATTGGA	2	12	3720	3731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373512
90	NC_018508	TTAA	2	8	3738	3745	50 %	50 %	0 %	0 %	434373512
91	NC_018508	TGG	2	6	3750	3755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434373512
92	NC_018508	CTT	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373512
93	NC_018508	CTTG	2	8	3780	3787	0 %	50 %	25 %	25 %	434373512
94	NC_018508	GAA	2	6	3831	3836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373512
95	NC_018508	TCT	2	6	3889	3894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373512
96	NC_018508	TGC	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434373512
97	NC_018508	TAT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373512
98	NC_018508	ATG	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373512
99	NC_018508	AT	3	6	4085	4090	50 %	50 %	0 %	0 %	434373512
100	NC_018508	TTC	2	6	4158	4163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373512
101	NC_018508	ATT	2	6	4164	4169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373512
102	NC_018508	GAA	2	6	4211	4216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373512
103	NC_018508	AGA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373512
104	NC_018508	CTA	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434373512
105	NC_018508	AAG	2	6	4252	4257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373512
106	NC_018508	AATA	2	8	4260	4267	75 %	25 %	0 %	0 %	434373512
107	NC_018508	T	6	6	4302	4307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018508	AGA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018508	A	6	6	4345	4350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018508	TGT	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434373513
111	NC_018508	AATGA	2	10	4483	4492	60 %	20 %	20 %	0 %	434373513
112	NC_018508	TA	3	6	4501	4506	50 %	50 %	0 %	0 %	434373513
113	NC_018508	ATG	2	6	4532	4537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373513
114	NC_018508	TGAT	2	8	4619	4626	25 %	50 %	25 %	0 %	434373513
115	NC_018508	AAG	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373513
116	NC_018508	AAG	2	6	4670	4675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373513
117	NC_018508	AAC	2	6	4724	4729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434373513
118	NC_018508	TACA	2	8	4765	4772	50 %	25 %	0 %	25 %	434373513
119	NC_018508	ACA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434373513
120	NC_018508	CGT	2	6	4843	4848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434373513
121	NC_018508	ATTA	2	8	4906	4913	50 %	50 %	0 %	0 %	434373513
122	NC_018508	TA	3	6	4965	4970	50 %	50 %	0 %	0 %	434373513
123	NC_018508	TTA	2	6	4985	4990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373513
124	NC_018508	TAT	2	6	5011	5016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373513
125	NC_018508	TGA	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373513
126	NC_018508	GAA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373513
127	NC_018508	TGT	2	6	5070	5075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434373513
128	NC_018508	TCG	2	6	5115	5120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434373513
129	NC_018508	GAAA	2	8	5157	5164	75 %	0 %	25 %	0 %	434373513
130	NC_018508	CAC	2	6	5179	5184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434373513
131	NC_018508	TAT	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373513
132	NC_018508	TCGT	2	8	5217	5224	0 %	50 %	25 %	25 %	434373513
133	NC_018508	ACGT	2	8	5238	5245	25 %	25 %	25 %	25 %	434373513
134	NC_018508	ATG	2	6	5258	5263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373513
135	NC_018508	GAAA	2	8	5280	5287	75 %	0 %	25 %	0 %	434373513
136	NC_018508	TTG	2	6	5312	5317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434373513
137	NC_018508	CTT	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373513
138	NC_018508	GTT	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434373513
139	NC_018508	CAT	2	6	5411	5416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434373513
140	NC_018508	ATTA	2	8	5430	5437	50 %	50 %	0 %	0 %	434373513
141	NC_018508	TGG	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434373513
142	NC_018508	ACA	2	6	5577	5582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434373513
143	NC_018508	GAAA	2	8	5640	5647	75 %	0 %	25 %	0 %	434373513
144	NC_018508	ACC	2	6	5694	5699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434373513
145	NC_018508	ATT	2	6	5729	5734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373513
146	NC_018508	TAA	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434373513
147	NC_018508	TTA	2	6	5806	5811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373513
148	NC_018508	GAA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373513
149	NC_018508	TCA	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434373513
150	NC_018508	TGAAT	2	10	6060	6069	40 %	40 %	20 %	0 %	434373514
151	NC_018508	AATT	2	8	6161	6168	50 %	50 %	0 %	0 %	434373514
152	NC_018508	TACA	2	8	6221	6228	50 %	25 %	0 %	25 %	434373514
153	NC_018508	AGA	2	6	6246	6251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373514
154	NC_018508	GAA	2	6	6316	6321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373514
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156	NC_018508	TCT	2	6	6332	6337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434373514
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158	NC_018508	AGATG	2	10	6444	6453	40 %	20 %	40 %	0 %	434373514
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160	NC_018508	ATT	2	6	6503	6508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373514
161	NC_018508	GTA	2	6	6526	6531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373514
162	NC_018508	TTA	2	6	6544	6549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373514
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170	NC_018508	CGCAA	2	10	6909	6918	40 %	0 %	20 %	40 %	434373514
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172	NC_018508	ATT	2	6	6988	6993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373514
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175	NC_018508	GAA	2	6	7048	7053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373514
176	NC_018508	A	6	6	7090	7095	100 %	0 %	0 %	0 %	434373514
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179	NC_018508	TAA	2	6	7200	7205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434373515
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201	NC_018508	AAGAT	2	10	8284	8293	60 %	20 %	20 %	0 %	434373515
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232	NC_018508	TAAG	2	8	9812	9819	50 %	25 %	25 %	0 %	434373515
233	NC_018508	TAT	2	6	9857	9862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_018508	AGT	2	6	9868	9873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_018508	TTG	2	6	9964	9969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
239	NC_018508	A	6	6	9975	9980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_018508	TAG	2	6	10315	10320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_018508	GTT	2	6	10346	10351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_018508	TA	3	6	10363	10368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_018508	AAG	2	6	10383	10388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_018508	GAA	2	6	10390	10395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_018508	A	6	6	10570	10575	100 %	0 %	0 %	0 %	434373517
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261	NC_018508	ACA	2	6	10669	10674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434373517
262	NC_018508	AAG	2	6	10795	10800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373517
263	NC_018508	AGAA	2	8	10877	10884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
264	NC_018508	ATA	2	6	10935	10940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434373518
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266	NC_018508	A	6	6	11017	11022	100 %	0 %	0 %	0 %	434373518
267	NC_018508	CAG	2	6	11025	11030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434373518
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269	NC_018508	A	6	6	11159	11164	100 %	0 %	0 %	0 %	434373518
270	NC_018508	TGT	2	6	11176	11181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434373518
271	NC_018508	GAAA	2	8	11200	11207	75 %	0 %	25 %	0 %	434373518
272	NC_018508	A	6	6	11219	11224	100 %	0 %	0 %	0 %	434373518
273	NC_018508	AGA	2	6	11233	11238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373518
274	NC_018508	AGA	3	9	11296	11304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373518
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398	NC_018508	GAA	2	6	15669	15674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_018508	ATA	2	6	15704	15709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_018508	A	6	6	15724	15729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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